Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprbB2RU80 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprbB2RU80 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms