Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trabd2bB1ATG9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trabd2bB1ATG9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trabd2bB1ATG9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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