Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tmem238A9JSM3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem238A9JSM3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem238A9JSM3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms