Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skint8A7XV07 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skint8A7XV07 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Skint8A7XV07 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint8A7XV07 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Skint8A7XV07 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint8A7XV07 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint8A7XV07 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skint8A7XV07 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint8A7XV07 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint8A7XV07 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint8A7XV07 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint8A7XV07 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint8A7XV07 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint8A7XV07 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint8A7XV07 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint8A7XV07 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint8A7XV07 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint8A7XV07 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skint8A7XV07 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Skint8A7XV07 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms