Protein–RNA interactions for Protein: A7M7C7

Skor2, SKI family transcriptional corepressor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,008 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor2A7M7C7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Skor2A7M7C7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skor2A7M7C7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Skor2A7M7C7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Skor2A7M7C7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Skor2A7M7C7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Skor2A7M7C7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Skor2A7M7C7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Skor2A7M7C7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Skor2A7M7C7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Skor2A7M7C7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Skor2A7M7C7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Skor2A7M7C7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Skor2A7M7C7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Skor2A7M7C7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Skor2A7M7C7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Skor2A7M7C7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Skor2A7M7C7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Skor2A7M7C7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms