Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc38A3KMP2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc38A3KMP2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc38A3KMP2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc38A3KMP2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc38A3KMP2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc38A3KMP2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc38A3KMP2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc38A3KMP2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc38A3KMP2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc38A3KMP2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc38A3KMP2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc38A3KMP2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc38A3KMP2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc38A3KMP2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc38A3KMP2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc38A3KMP2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc38A3KMP2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc38A3KMP2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc38A3KMP2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc38A3KMP2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
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