Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga8A2ARA8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itga8A2ARA8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga8A2ARA8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms