Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll9A2APC3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll9A2APC3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttll9A2APC3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttll9A2APC3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttll9A2APC3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttll9A2APC3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms