Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ambra1A2AH22 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ambra1A2AH22 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ambra1A2AH22 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ambra1A2AH22 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ambra1A2AH22 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms