Protein–RNA interactions for Protein: A2AAY5

Sh3pxd2b, SH3 and PX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2bA2AAY5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3pxd2bA2AAY5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3pxd2bA2AAY5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3pxd2bA2AAY5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3pxd2bA2AAY5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3pxd2bA2AAY5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3pxd2bA2AAY5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3pxd2bA2AAY5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3pxd2bA2AAY5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3pxd2bA2AAY5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3pxd2bA2AAY5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms