Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdc27A2A6Q5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdc27A2A6Q5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdc27A2A6Q5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms