Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sycp2lA0A0M3U1B0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sycp2lA0A0M3U1B0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sycp2lA0A0M3U1B0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms