Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms