Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcniQ9Z2V9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CcniQ9Z2V9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CcniQ9Z2V9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CcniQ9Z2V9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CcniQ9Z2V9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CcniQ9Z2V9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CcniQ9Z2V9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CcniQ9Z2V9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CcniQ9Z2V9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CcniQ9Z2V9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CcniQ9Z2V9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CcniQ9Z2V9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms