Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms