Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N7

Arid3b, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3bQ9Z1N7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arid3bQ9Z1N7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arid3bQ9Z1N7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arid3bQ9Z1N7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Arid3bQ9Z1N7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms