Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1F6

Cnmd, Leukocyte cell-derived chemotaxin 1, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnmdQ9Z1F6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CnmdQ9Z1F6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CnmdQ9Z1F6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CnmdQ9Z1F6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms