Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slfn1Q9Z0I7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slfn1Q9Z0I7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slfn1Q9Z0I7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slfn1Q9Z0I7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slfn1Q9Z0I7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.4 ms