Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lemd3Q9WU40 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Lemd3Q9WU40 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Lemd3Q9WU40 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Lemd3Q9WU40 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Lemd3Q9WU40 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Lemd3Q9WU40 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lemd3Q9WU40 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lemd3Q9WU40 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lemd3Q9WU40 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Lemd3Q9WU40 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Lemd3Q9WU40 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lemd3Q9WU40 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lemd3Q9WU40 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lemd3Q9WU40 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Lemd3Q9WU40 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Lemd3Q9WU40 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Lemd3Q9WU40 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Lemd3Q9WU40 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Lemd3Q9WU40 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Lemd3Q9WU40 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lemd3Q9WU40 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lemd3Q9WU40 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Lemd3Q9WU40 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Lemd3Q9WU40 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Lemd3Q9WU40 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Lemd3Q9WU40 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Lemd3Q9WU40 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Lemd3Q9WU40 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Lemd3Q9WU40 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Lemd3Q9WU40 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Lemd3Q9WU40 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lemd3Q9WU40 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lemd3Q9WU40 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lemd3Q9WU40 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lemd3Q9WU40 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lemd3Q9WU40 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lemd3Q9WU40 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lemd3Q9WU40 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lemd3Q9WU40 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lemd3Q9WU40 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lemd3Q9WU40 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lemd3Q9WU40 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Lemd3Q9WU40 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Lemd3Q9WU40 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Lemd3Q9WU40 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Lemd3Q9WU40 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Lemd3Q9WU40 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Lemd3Q9WU40 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lemd3Q9WU40 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lemd3Q9WU40 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Lemd3Q9WU40 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms