Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf103Q9R1W3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf103Q9R1W3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf103Q9R1W3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf103Q9R1W3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf103Q9R1W3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf103Q9R1W3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf103Q9R1W3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf103Q9R1W3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf103Q9R1W3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf103Q9R1W3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf103Q9R1W3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf103Q9R1W3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf103Q9R1W3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf103Q9R1W3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf103Q9R1W3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf103Q9R1W3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms