Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcm1Q9R0L6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcm1Q9R0L6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcm1Q9R0L6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms