Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vnn3Q9QZ25 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vnn3Q9QZ25 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Vnn3Q9QZ25 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vnn3Q9QZ25 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms