Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmeff2Q9QYM9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmeff2Q9QYM9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmeff2Q9QYM9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmeff2Q9QYM9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmeff2Q9QYM9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmeff2Q9QYM9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmeff2Q9QYM9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmeff2Q9QYM9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms