Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plxnb3Q9QY40 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Plxnb3Q9QY40 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plxnb3Q9QY40 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plxnb3Q9QY40 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plxnb3Q9QY40 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plxnb3Q9QY40 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plxnb3Q9QY40 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Plxnb3Q9QY40 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Plxnb3Q9QY40 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plxnb3Q9QY40 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plxnb3Q9QY40 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plxnb3Q9QY40 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plxnb3Q9QY40 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plxnb3Q9QY40 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plxnb3Q9QY40 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Plxnb3Q9QY40 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Plxnb3Q9QY40 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Plxnb3Q9QY40 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plxnb3Q9QY40 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plxnb3Q9QY40 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plxnb3Q9QY40 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plxnb3Q9QY40 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plxnb3Q9QY40 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plxnb3Q9QY40 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Plxnb3Q9QY40 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plxnb3Q9QY40 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms