Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Foxe3Q9QY14 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Foxe3Q9QY14 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Foxe3Q9QY14 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Foxe3Q9QY14 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Foxe3Q9QY14 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms