Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PolkQ9QUG2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PolkQ9QUG2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PolkQ9QUG2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PolkQ9QUG2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PolkQ9QUG2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PolkQ9QUG2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PolkQ9QUG2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PolkQ9QUG2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PolkQ9QUG2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PolkQ9QUG2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PolkQ9QUG2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PolkQ9QUG2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PolkQ9QUG2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PolkQ9QUG2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PolkQ9QUG2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PolkQ9QUG2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PolkQ9QUG2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PolkQ9QUG2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PolkQ9QUG2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms