Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrfQ9JM73 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SrfQ9JM73 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrfQ9JM73 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SrfQ9JM73 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrfQ9JM73 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SrfQ9JM73 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrfQ9JM73 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrfQ9JM73 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrfQ9JM73 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms