Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod2Q9JKK7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
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Tmod2Q9JKK7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
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Tmod2Q9JKK7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmod2Q9JKK7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
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Tmod2Q9JKK7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
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Tmod2Q9JKK7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmod2Q9JKK7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmod2Q9JKK7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmod2Q9JKK7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
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Tmod2Q9JKK7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmod2Q9JKK7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmod2Q9JKK7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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Tmod2Q9JKK7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
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Tmod2Q9JKK7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
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Tmod2Q9JKK7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
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Tmod2Q9JKK7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
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Tmod2Q9JKK7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmod2Q9JKK7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
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Tmod2Q9JKK7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
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Tmod2Q9JKK7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tmod2Q9JKK7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmod2Q9JKK7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmod2Q9JKK7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmod2Q9JKK7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmod2Q9JKK7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmod2Q9JKK7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmod2Q9JKK7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmod2Q9JKK7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmod2Q9JKK7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmod2Q9JKK7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
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