Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnga3Q9JJZ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnga3Q9JJZ8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga3Q9JJZ8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga3Q9JJZ8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga3Q9JJZ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga3Q9JJZ8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga3Q9JJZ8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga3Q9JJZ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga3Q9JJZ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga3Q9JJZ8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga3Q9JJZ8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga3Q9JJZ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga3Q9JJZ8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga3Q9JJZ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga3Q9JJZ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cnga3Q9JJZ8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cnga3Q9JJZ8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnga3Q9JJZ8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
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