Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Alyref2Q9JJW6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Alyref2Q9JJW6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Alyref2Q9JJW6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Alyref2Q9JJW6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Alyref2Q9JJW6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Alyref2Q9JJW6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Alyref2Q9JJW6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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