Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV5

Cacng3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng3Q9JJV5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacng3Q9JJV5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacng3Q9JJV5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacng3Q9JJV5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacng3Q9JJV5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacng3Q9JJV5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms