Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJC9

Herpud2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud2Q9JJC9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Herpud2Q9JJC9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Herpud2Q9JJC9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Herpud2Q9JJC9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Herpud2Q9JJC9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms