Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIK5

Ddx21, Nucleolar RNA helicase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx21Q9JIK5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ddx21Q9JIK5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx21Q9JIK5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddx21Q9JIK5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx21Q9JIK5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms