Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Tssc4Q9JHE7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tssc4Q9JHE7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Tssc4Q9JHE7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tssc4Q9JHE7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Tssc4Q9JHE7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Tssc4Q9JHE7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tssc4Q9JHE7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tssc4Q9JHE7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Tssc4Q9JHE7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Tssc4Q9JHE7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Tssc4Q9JHE7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Tssc4Q9JHE7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tssc4Q9JHE7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tssc4Q9JHE7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tssc4Q9JHE7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tssc4Q9JHE7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tssc4Q9JHE7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tssc4Q9JHE7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tssc4Q9JHE7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tssc4Q9JHE7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Tssc4Q9JHE7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tssc4Q9JHE7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Tssc4Q9JHE7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Tssc4Q9JHE7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tssc4Q9JHE7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Tssc4Q9JHE7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Tssc4Q9JHE7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Tssc4Q9JHE7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tssc4Q9JHE7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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