Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sgf29Q9DA08 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sgf29Q9DA08 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgf29Q9DA08 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms