Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D8Q6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8Q6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8Q6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms