Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alkbh4Q9D8F1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alkbh4Q9D8F1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Alkbh4Q9D8F1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Alkbh4Q9D8F1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms