Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl4Q9D8E6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl4Q9D8E6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl4Q9D8E6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms