Protein–RNA interactions for Protein: Q9D875

2010109A12Rik, MCG1041431, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109A12RikQ9D875 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
2010109A12RikQ9D875 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
2010109A12RikQ9D875 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
2010109A12RikQ9D875 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms