Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gbe1Q9D6Y9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gbe1Q9D6Y9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms