Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptp4a3Q9D658 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms