Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zc2hc1bQ9D534 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms