Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf6Q9D4J7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf6Q9D4J7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf6Q9D4J7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf6Q9D4J7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf6Q9D4J7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf6Q9D4J7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf6Q9D4J7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf6Q9D4J7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf6Q9D4J7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf6Q9D4J7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms