Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V8

Fam227a, Family with sequence similarity 227, member A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227aQ9D3V8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam227aQ9D3V8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fam227aQ9D3V8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam227aQ9D3V8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam227aQ9D3V8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms