Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx29Q9D3S3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx29Q9D3S3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx29Q9D3S3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx29Q9D3S3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx29Q9D3S3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms