Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D2Q3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Q9D2Q3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q9D2Q3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms