Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spns3Q9D232 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Spns3Q9D232 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spns3Q9D232 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.9 ms