Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shmt2Q9CZN7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shmt2Q9CZN7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shmt2Q9CZN7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shmt2Q9CZN7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shmt2Q9CZN7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shmt2Q9CZN7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shmt2Q9CZN7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Shmt2Q9CZN7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shmt2Q9CZN7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shmt2Q9CZN7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shmt2Q9CZN7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shmt2Q9CZN7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shmt2Q9CZN7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shmt2Q9CZN7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Shmt2Q9CZN7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shmt2Q9CZN7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms