Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bud23Q9CY21 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bud23Q9CY21 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bud23Q9CY21 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bud23Q9CY21 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bud23Q9CY21 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bud23Q9CY21 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bud23Q9CY21 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bud23Q9CY21 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bud23Q9CY21 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bud23Q9CY21 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Bud23Q9CY21 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Bud23Q9CY21 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bud23Q9CY21 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bud23Q9CY21 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bud23Q9CY21 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bud23Q9CY21 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bud23Q9CY21 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bud23Q9CY21 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Bud23Q9CY21 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Bud23Q9CY21 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bud23Q9CY21 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bud23Q9CY21 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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