Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmed5Q9CXE7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed5Q9CXE7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmed5Q9CXE7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms